в базу добавились эти 100 000 строк ?

ответил в ЛС

в начало скрипта добавь

ini_set('memory_limit', '-1');
ini_set('max_execution_time', 0);

и будет сщастье

_____________

можно вместо запроса записать результат в файл. А потом "скормить" его Mysql через импорт.
Это по моему проще, чем бить массив на N частей.
вместо

mysql_query ($sql) or die(mysql_error() ); 

написать

file_put_contents('sql.txt', $sql);

вот как-то так

header("Content-Type: text/html; charset=utf-8");

//подключаем настройки
include 'config.php';

// Выводим все ошибки кроме нотисов
Error_Reporting(E_ALL & ~E_NOTICE);

echo 'Использовано соединение с ' .$db_host.'<br>';
echo 'База данных с именем ' .$db_name.'<br>';
echo  'Пароль базы данных ' .$db_pass.'<br>';
echo 'Работаем с таблицей ' .$db_table.'<br>';

// соединяемся с БД
$db = mysql_connect($db_host, $db_name, $db_pass) or die('Не удалось соединиться: ' . mysql_error());
echo 'Соединение успешно установлено<br>';

// выбираем таблицу с которой будем работать
mysql_select_db($db_table) or die('Не удалось выбрать базу данных');

$lines = file('mail.html');
$add = array();
foreach ($lines as $line) {
  $temp_line = explode(' ', trim($line));
  $temp_mail = explode('@', $temp_line[0]);
  $temp_pref_pas = explode('.', $temp_mail[1]);
 
  $add[] = "('$temp_mail[0]','$temp_pref_pas[0]', '$temp_line[1]')";
}

echo 'Массив имеет '.count($add).' ед.';
$sql = "INSERT INTO mail (name,pref,pas) VALUE ".implode(',',$add);
file_put_contents('sql.txt', $sql);