А почему JS код не желательно выводить с помощью оператора echo ?

Потому что если ты будешь работать не в Блокноте, а в нормальной IDE, то ты не сможешь использовать ее возможности. По сути, даже в навороченной системе ты продолжишь работать с кодом также, как в Блокноте.
Дело в том, что нормальные системы очень много помогают. При одном условии: если они видят код, а не текст.
Например, найдут много разных ошибок/опечаток. Позволят перейти к объявлению функции (например, Ctrl+click). Делают подсветку кода. И много чего другого полезного.

Да и сам ты не сможешь нормально отлаживать код, когда он просто как текст написан, а не как код.

Плюс к этому, если ты записал JS внутри скрипта ПХП, то этот JS будет грузиться каждый раз целиком. Если же он записан в отдельном скрипте JS, то он не грузится каждый раз.
Также, ты будешь вынужден копипастить одни и те же функции JS в разные места... А это тоже плохо.

Я тут дорабатываю один проект. Так прежний программист, наверное, каждый день "икает" В том числе и по причине кода JS, записанного в виде текста. Строк эдак 300-400-500 (в разных файлах по-разному).

Ну так что, убедил?

_____________
* Хэлп по PHP
* Описалово по JavaScript
* Хэлп и СУБД для PostgreSQL

* Обучаю PHP, JS, вёрстке. Интерактивно и качественно. За разумные деньги.

* "накапливаю умение телепатии" (С) и "гуглю за ваш счет" (С)

Да, действительно, надо вынести весь JS из echo