Как вариант для MyISAM...
Изучите key_buffer_size (и связанные с ним параметры). Возможно он слишком маленький.

п.с. Я myISAM не пользую, поэтому результат не гарантирую. Нужно пытать.

_____________
Рекламка / ad.pesow.com Хрень / mr-1.ru

А вот это вовсе не факт! В настоящее время не хочу лезть в дебри, но скопировать может быть быстрее. Другое дело, что ты должен на время вывести данные из обработки - вот тут да, минус есть.

_____________
* Хэлп по PHP
* Описалово по JavaScript
* Хэлп и СУБД для PostgreSQL

* Обучаю PHP, JS, вёрстке. Интерактивно и качественно. За разумные деньги.

* "накапливаю умение телепатии" (С) и "гуглю за ваш счет" (С)