примерно вот так

protected function sql($sql){
		$this -> con = $this -> database_connect();
		return $this -> con -> query($sql);
	}

neadekvat, а есть какая то разница между этим запросом

protected function sql($sql){
		$this -> con = $this -> database_connect();
		return $this -> con -> query($sql);
	}

и вот этим

protected function sql($sql){
		return $this -> database_connect() -> query($sql);
	}

который напрямую обращается к методу.. и вообще логично ли делать такие дела таким методом!?

Да, используется новый член класса, но я не вижу смысла так делать.