С помощью различных методов обфускации. Один из таких методов предлагает широкоизвестная программа-модуль ionCube. Главное неудобство подобных систем заключается в обязательной установке PHP модулей-дешифраторов на клиентских серверах.

Для компилируемых языков программирования, самый простой способ закрыть свой код - распространять готовые бинарники под различные архитектуры. Кстати, например в Arch Linux именно так и сделано, но не для скрытия кода совершенно.

А зачем? Поддерживать сишный проект, да еще и в бинарниках, вещь не очень простая = дорогостоящая. Потому что это и тестирование на различных платформах, версиях и ОС-ках. Кто это будет всё делать, а главное, ради чего? Если проект достаточно крупный и интересный бизнесу, то пиратками один фиг не будут пользоваться, потому что фирмам гораздо важнее поддержка, чем экономия в $500-1000 за лицензию.

С другой стороны, если особенно не препятствовать пиратскому использованию, получается весьма недурная реклама. Можно ведь создать бугурт в правовом поле, для больмень уважающих себя юрлиц этого будет вполне достаточно.

Да? А ты часто устанавливаешь стрёмные бинарники от ХЗ какого вендора?

Для ПХП есть разные библиотеки. Которые хрен знает от какого вендора. Например, для работы с некоторыми видами баз данных.
Что касается разных ОС... Сишный код универсальный Ты ж можешь, например, скачать код ПХП и скомпилировать его самостоятельно. И библиотеку скомпилируй, только сам, не давай код никому.

_____________
* Хэлп по PHP
* Описалово по JavaScript
* Хэлп и СУБД для PostgreSQL

* Обучаю PHP, JS, вёрстке. Интерактивно и качественно. За разумные деньги.

* "накапливаю умение телепатии" (С) и "гуглю за ваш счет" (С)

Сишный код совсем не универсальный между разными семействами ОС. Чтобы он таковым стал, нужно приложить значительные усилия. По факту он будет конечно же разным, просто система сборки подберет для компиляции нужные файлы. В некотором смысле полиморфизм.

Именно поэтому так популярен платформо-независимый язык Java, где весь страшенный гемор различий архитектур и ОС, берет на себя виртуальная машина. А то бы нифига такие решения не взлетели, если чо! ))) Как и многие другие ЯП, просто с Си в данном контексте уместнее всего сравнивать джаву.

Конечно если программа не Hello world. Иначе бы крупные вендоры выпускали свои проф. продукты в бинарниках под Linux и в хрен не дули. Кстати, я бы даже может кое-что прикупил из такого ПО.