Он возможно имел ввиду, сохранят на сервер и одновременно на комп себе

Редирект в браузере на адрес файла?

_____________
Бесплатному сыру в дырки не заглядывают...

Это не просто. А очень просто :) Делаешь ссылку на загрузку. По ссылке делаешь загрузку файла. В скрипте-обработчике прописываешь такую штуковину, в самом начале (код я взял у себя из рабочего скрипта):

	header('Content-Description: File Transfer');
	header('Content-Type: application/octet-stream');
	header("Content-Disposition: attachment; filename=$file_name");
	header('Content-Transfer-Encoding: binary');

а затем делаешь вывод собственно содержимого файла. Кстати говоря, вовсе не обязательно этот файл записывать на диск! Можно создавать динамически, точно также, как ПХП-страницу. И тут же отдавать в поток.

В итоге при клике по ссылке у тебя в браузере появляется запрос на скачку файла. Указываешь, куда сохранить и сохраняешь. Переменная $file_name содержит то имя файла, которое увидит юзер при загрузке.
Существенно то, что текущая страница так и остается в браузере нетронутой, не перезагружается.

Профит!

_____________
* Хэлп по PHP
* Описалово по JavaScript
* Хэлп и СУБД для PostgreSQL

* Обучаю PHP, JS, вёрстке. Интерактивно и качественно. За разумные деньги.

* "накапливаю умение телепатии" (С) и "гуглю за ваш счет" (С)

Еще раз повторяю:

Убери fwrite и все другие функции записи в файл, сделай тут вывод через echo и всё у тебя будет работать.
Пустой файл потому, что ты в него ничего и не пишешь :) Т.е., клиенту ничего не отправляешь.

header('Content-Description: File Transfer');
header('Content-Type: application/octet-stream');
header("Content-Disposition: attachment; filename='export.csv'");
header('Content-Transfer-Encoding: binary');

include_once($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"]."/inc/connect.php");

$query = "SELECT * FROM flat";
$apartments = mysql_query($query) or die(mysql_error());

//$myfile = fopen("export.csv", "w") or die("Unable to open file!");

while($aprt = mysql_fetch_array($apartments))
{
	$txt = $aprt['code'] . "," . $aprt['page_full_path'] . "\r\n";
	//fwrite($myfile, $txt);
	echo $txt;
}
//fclose($myfile);

_____________
* Хэлп по PHP
* Описалово по JavaScript
* Хэлп и СУБД для PostgreSQL

* Обучаю PHP, JS, вёрстке. Интерактивно и качественно. За разумные деньги.

* "накапливаю умение телепатии" (С) и "гуглю за ваш счет" (С)

Да и пользуйся на здоровье

Вообще говоря, таким же образом можно отправлять и уже готовые, ранее созданные файлы. Но при этом ты можешь добавить функционал по контролю за скачиванием:
- есть ли право на закачку этих данных у данного юзера,
- не истек ли период, когда есть разрешение на закачку
- ... да и мало ли, что еще можно придумать...

Плюс к этому, если подготовка данных занимает какое-то заметное время, то можно с помощью кук и JS организовать процесс информирования юзера о подготовке данных.

_____________
* Хэлп по PHP
* Описалово по JavaScript
* Хэлп и СУБД для PostgreSQL

* Обучаю PHP, JS, вёрстке. Интерактивно и качественно. За разумные деньги.

* "накапливаю умение телепатии" (С) и "гуглю за ваш счет" (С)