А по какому параметру сортировать нужно?
т.е. по какому параметру вы узнаете, что нужно выводить, а что нет?

Перефразирую вопрос! Таблица "jb_city" это таблица городов. Соответственно в таблице "jb_cat" храниться информация всех городов таблицы "jb_sity".
Этим запросом выводиться информация таблицы "jb_cat" всех городов таблицы "jb_city":

if (defined('JBCITY')) $GLOBALS['subQuery'] = ' AND city_id = '.JBCITY; else $GLOBALS['subQuery'] = '';
function listcat2($id,$sub){
	$categories = mysql_query("SELECT id, child_category, name_cat, en_name_cat FROM jb_cat WHERE root_category = $id ORDER by sort_index"); cq();

Мне нужно изменить этот запрос так, чтобы выводилась информация из таблицы "jb_cat" только одного города таблицы "jb_city"

function listcat2($id,$sub){
	$categories = mysql_query("SELECT id, child_category, name_cat, en_name_cat FROM jb_cat WHERE root_category = $id ORDER by sort_index"); cq(); 

WHERE root_category = $id
поле root_category должно совпадать с $id (я так понимаю это id в таблице jb_city)

как ты передаешь переменную $id в функцию listcat2 ???
function listcat2($id,$sub)