Так работает:

str_replace($setname."=".'"'.$setting[$setname].'"',$setname."=".'"'."1".'"',$file_data);

А так нет:
Когда вместо " &quot то не работает, как вставить в str_replace '&qout', что бы переходил как ".

P.S: Все таки выбрал для конфига ini файл, и уже научился изменять данные, как показано вверху!

Это что вообще ?, я не понял ни вопроса... ни примера... - все так "подробно"...