Просто setcookie('id', '')

И Cookies устанавливются не для страницы, а для сайта целиком. В твоем случае для localhost.
И все равно, на какой странице кукис установили, на какой его прочитали и на какой его удалили. Это могут быть 3 разные страницы.

setcookie('id', '', time() - (60*60*24*7), '/');

Ser18

Кука привязана к конкретному сайту и хранится она не на сервере...т.е. localhot/site/.../..., а у тебя на компе клиента в куках...типа C:/Documents and Settings/Admin/Cookies

Я знаю что она хранится у клиента и отсылается пи каждом запросе

Так я удаляю данные о пользователе в /site/index.php

if(isset($_GET['user']) and $_GET['user'] == 'exit'){
	setcookie('id', '', time() - (60*60*24*7));
	setcookie('hash', '', time() - (60*60*24*7));
	unset($_SESSION['id']);
	unset($_SESSION['hash']);
	header("Location: ".$_SERVER['HTTP_REFERER']."");
	exit();
}

Так авторизую пользователя при переходе по страницам в том же файле

if(isset($_COOKIE['id']) or isset($_COOKIE['hash'])){
	setcookie('id', $_COOKIE['id'], time() + (60*60*24*7));
	setcookie('hash', $_COOKIE['hash'], time() + (60*60*24*7));	
	$_SESSION['id'] = $_COOKIE['id'];
	$_SESSION['hash'] = $_COOKIE['hash'];
}

if(isset($_SESSION['id']) or isset($_SESSION['hash'])){
	$res_verifier_user = mysql_query("SELECT `user_name` 
							   		  FROM `users` WHERE `user_id`='".(int)$_SESSION['id']."'
											AND 
											`user_hash`='".mysql_real_escape_string($_SESSION['hash'])."'");
	$row_verifier_user = mysql_num_rows($res_verifier_user);
	if($row_verifier_user > 0){
		$user_autor = true;
		$row_user = mysql_fetch_assoc($res_verifier_user);
	}else{
		unset($_SESSION['id']);
		unset($_SESSION['hash']);
		header("Location: index.php");
		exit();
	}
}

Так я удаляю данные о пользователе в /site/adm/index.php

if(isset($_GET['exit']) and $_GET['exit'] == 'adm'){
	setcookie('id', '', time() - (60*60*24*7));
	setcookie('hash', '', time() - (60*60*24*7));
	unset($_SESSION['id']);
	unset($_SESSION['hash']);
	header("Location: index.php");
	exit();
}

Так авторизую пользователя при переходе по страницам в /site/adm/index.php

if(isset($_COOKIE['id']) or isset($_COOKIE['hash'])){
	$res_verifier_user = mysql_query("SELECT COUNT(*) 
							   FROM `users` WHERE `user_id`='".(int)$_COOKIE['id']."'
											AND 
											`user_hash`='".mysql_real_escape_string($_COOKIE['hash'])."'
											AND 
											`id_rang_user` = 1");
	$row_verifier_user = mysql_fetch_array($res_verifier_user);
	if($row_verifier_user[0] > 0){
		$_SESSION['id'] = $_COOKIE['id'];
		$_SESSION['hash'] = $_COOKIE['hash'];
	}else{
		unset($_SESSION['id']);
		unset($_SESSION['hash']);
		setcookie('id', '', time() - (60*60*24*7));
		setcookie('hash', '', time() - (60*60*24*7));
		header("Location: index.php");
		exit();
	}
}

По поводу

if(isset($_COOKIE['id']) or isset($_COOKIE['hash'])){

Вы правы, должен and стоять - заметил только когда сообщение писал (но это не особо важно)

Написана админка отдельно от сайта (нет общих файлов), общая только БД
Хотелось сделать чтоб при входе в админку, автоматически входило и на сайт (и наоборот) - это все работает, а вот выход не работает.
Если авторизуюсь на сайте, то из админки выйти не могу, а если авторизуюсь в админке, то выходит везде где надо

Я на сайте куки присваиваю сессии

$_SESSION['id'] = $_COOKIE['id'];
$_SESSION['hash'] = $_COOKIE['hash'];

Потому что при авторизации пользователь мог поставить галочку - запомнить
Вот я и проверяю, если есть куки, то я их продлеваю и присваиваю их сессии, а потом работаю с сессией

В админке такого нет потому, что там нет галочки запомнить и при авторизации значения записываются сразу в куки

Так я и куки удаляю

setcookie('id', '', time() - (60*60*24*7));
setcookie('hash', '', time() - (60*60*24*7));

Длительность жизни куки, текущее время минус неделя

Ser18

сами куки и $_COOKIE['id'] разные вещи

Ser18

куки - файлы у клиента, $_COOKIE['id'] - переменная на сервере, когда через setcookie удаляешь куки у клиента до тех пор пока браузер запущен $_COOKIE['id'] существует, удалить ее можно через unset. Вот они возможно и ловятся вот здесь хотя сами куки удалены:

Через unset тоже не работает