добрый день.

1) меем html приблизительно следующего вида.

<div class="page" id='1'>
            здесь содержится всякий html 
            <div class="column" id='1'>
                      здесь содержится html 
             </column>
                      здесь содержится всякий html 
            <div class="column" id='2'>
                      здесь содержится  html
             </column>
             ... другие column.
</div>

2) Jquery формирует из html некое подобие xml, вида

<page id='1'>
<column id='1'>
html
</column>
<column id='2'>
html
</column>
</page>

это результат передаётся серверу get запросом

2) на сервере специальный парсер разбирает полученные данные на column'ы и сохраняет содержимое каждого column'а в свою строчку таблицы с указанием id, к которой относится column и page в который он входит.
=====================================================

во всей этой архитектуре мне не нравится промежуточное преобразование к которому я вынужден прибегать, то есть кодер в клиенте, и парсер на сервере.

Более приятным решением могла бы оказатся утрамбовка данных в многомерный массив(yii-каким то образом такие поддерживает) да хотябы в одномерный(многомрности можно добавить и через смещние индекса) . Однако опять же не приведёт ли html содержимое к невозможности прочитать этот массив, надо пробывать. Такой подход мог бы избавить меня от парсера на сервере.

Чистый xml использовать опять же сложно. Так как у columna в html содержимом может быть div содержащий в себе другой Column или page которые надо обрабатывать отдельно. Иными словами <![CDATA[ тут не панацея, если только отрывать и закрывать её постоянно. Хм дак опять же не будет ли xml движок возвращать содержимое только первого cdata.

иными словами вопрос.
================
как лучше передать на сервер и обработать на сервере содержимое всех column c указанием column id и page. то что находится между column нас не интересует.

Точнее как бы сделали вы.