window.onload = function(){
      getStruct(); // подгружает DOM элементы через ajax и добавляет на страницу

      openStruct(); // функция работает с подгруженной структурой
}

window.onload = function(){
      getStruct('0'); // подгружает родительский DOM элемент через ajax и добавляет на страницу

      openStruct();
}

function openStruct(){
// достает элементы из куки и передает в edClass, но цикл не дожидается полного выполнения edClass, из-за чего node не может найти элемент с заданным id, еще не построен в DOM


	if(get_cookie('c_openStruct')){
		var openStruct = get_cookie('c_openStruct');
		var aux = openStruct.split(',');
		aux.pop();
		for(var i in aux){
			edClass(aux[i]);
		}
	}
}

function edClass(id){
var node = document.getElementById(id);

// какие-то операции c node

getStruct(id); // строит дочерние элементы для node
}


function getStruct(id){

	jQuery.ajax({
		type: "POST",
		url: "файл",
		data: "id=" + id,
		success: function(struct){
			$("#container").html(struct);

// получаем дочерние элементы и строим их, если openStruct() записать сюда, то будет бесконечный цикл, т.к. в каждом getStruct будет полностью перебираться цикл из openStruct() который опять же вызывает getStruct 

		}
	});
}